从公元前1050年伊奥尼亚人重建米利都，到公元前6世纪中期，被吕底亚国王克罗伊索斯征服，米利都在四个多世纪中保持着独立地位。

关于荷马时代米利都的政体形式所知不多，根据古代文献记载，伊奥尼亚人定居米利都后，由奈莱乌斯家族实行国王统治，但是没有相应的实物证据可以证明其真实性。

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进入古风时代后，据希罗多德和普鲁塔克记载，以及现代学者分析可知：公元前8世纪末或前7世纪初，米利都由托阿斯和达马瑟诺尔实行僭主制，经过两任僭主统治后，米利都政体转换为由少数富人组成的、带有贵族色彩的寡头制。

他们对两任僭主的追随者采取严厉措施，引发长时间国内阶级冲突，冲突经帕罗斯人调停平息后，米利都建立了由土地所有者组成的新寡头政府。在新寡头政府的统治下，米利都逐渐稳定下来，为经济和文化发展创造了有利条件。

此后，米利都国力呈现上升之势，即使被强大的吕底亚王国，劫掠半个多世纪也没有衰落。吕底亚攻势增强给特拉叙布鲁斯的崛起提供了机会，他于公元前7世纪末夺取米利都高统治权成为僭主。特拉叙布鲁斯统治结束后，米利都又恢复了寡头制。

公元前560年，克罗伊索斯继承吕底亚王位，他重新开启与伊奥尼亚诸城邦之间的战争，并逐一征服了它们，米利都就此丧失独立地位。但克罗伊索斯统治伊奥尼亚的时间很短，公元前547年，波斯国王居鲁士征服吕底亚和伊奥尼亚。

在波斯统治期间，米利都建立起“不受欢迎的僭主制”，并持续了四十年，直到僭主滥用权力导致米利都人发动起义，试图脱离波斯统治。

综上所述，荷马时代米利都实行国王制。进入古风时代后，与其他希腊城邦相同，通过僭主制过渡，米利都建立了由少数富人组成的、带有贵族色彩的寡头制，在公元前8世纪末或前7世纪初，米利都国内发生阶级冲突，经帕罗斯人调停后，寡头政府的统治阶级扩大到土地所有者。