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跑步脚上磨出水泡可以采用一般治疗，药物治疗等处理。

1.一般治疗：注意清洁卫生，保持脚底皮肤干燥，可暂时穿拖鞋；多休息，避免跑步或长时间走路；注意不要弄破水泡，避免出现感染。饮食清淡营养，避免进食辛辣、刺激食物，多吃新鲜蔬菜水果。

2.药物治疗：如果水泡小，一般可以自行吸收；若水泡过大，机体不能充分吸收，可以用碘伏消毒以后，用无菌空针抽吸出里面的液体；再遵医嘱使用生长因子等药物，帮助创面愈合。

跑步后脚上被磨出水泡，平时注意不要长时间跑步，应该适当休息，更换合适、舒适的鞋子及袜子，保持脚部清洁卫生。如果水泡比较小可以不用处理，让其自己慢慢吸收。如果水泡过大，出现破溃、感染等症状，建议前往医院，规范治疗。