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跟很多朝代，清朝源自关外，最初在医药上，较为原始，仍保留很多过去巫师萨满的色彩。一旦生病，大多采取祭祀祷的办法。直到努尔哈赤时，才开始逐渐转向医药，并有较大的进步。当时已经开始用煮晒人参时出现的蒸馏水去治疗皮肤疾病。皇太极后，效仿明朝明朝制度，设立六部。

因为是草创阶段，许多体制都非常简陋，并没有设立专门的医官制度。但当时已经明确提出，要抑制巫术，采用医药治病。这个做法，为后来清朝医官制度的设立，奠定基础。顺治年间，清朝正式定太医院作为专门的医官机构，并设立相关的医官职位。

在太医院中工作的可以分为两种人。一种是没有官阶品级，如食粮医生、切造医生，负责文书、制药等工作。一种是有官阶品级，如正官院使，左右院判、御史、吏目。它们品级官阶不同，负责事务不同。在这些人中，御医无论是人数份额、医术的专业程度上，都占据中流砥柱的位置。

因为御医的看病对象，主要是皇帝、亲王大臣、后宫嫔妃等，遇到特殊情况，还会被送到前线当军医。御医的本事高低，直接关系到病人的生死存亡。所以，选拔一批有足够专门素质的御医，一直是太医院的重要工作之一。

过去对医生的看法，一直认为资历越久，经验越丰富，看病的本事也越大。在这种观念的影响下，太医院的人事选拔，基本按照级别依次递进。

清朝太医院的官职，按照级别，依次分为院使、左院判、右院判、御医、七品吏目、八品吏目。八品吏目以下，属于介于从九品和不入流之间的医士。医士再往下，就是恩粮生。

如果按照太医院正常程序走的话，御医往下的职位，只要能够一步步往上升，都有机会达到这个位置。当然，要等到御医出现空额。因为清朝的时候，太医院的御医数量是固定的。虽然不同时期，人数不同。如雍正年间增设御医5员，道光年间裁撤御医2员。可是，总体人数不会太多。御医下面的人，基本需要熬到有人退休，才可以补缺。

当然，为了防止滥竽充数的情况出现，对于这些举荐的人才，还要经过太医院考核，确认有真本事，才可以入职。

如果遇到太医院实在缺人，朝廷还会从民间直接选拔医生。选拔对象包括贡生、举人，民间精通医理的医生，都可以参加。如果是贡生、举人，需要到当地官府办理证明，到太医院报名。普通医生直接到太医院参选即可。通过选拔后，照例授予职位，跟着层层升迁。

但是，如果皇帝下旨的话，极有可能破格提拔，直接成为御医。太医院内，也有一个教习厅，专门培养太医人才。教习厅内的老师，都是从太医院从选择医术较高的人才，学生基本是医官们的孩子。这些人将来都是有可能成为御医的。学的内容，也是以《素问》、《本草纲目》、《伤寒论》三本医书为主。